Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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