Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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