Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
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