Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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