Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBX1P83916 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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