Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSCP56915 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms