Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP4P49662 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP4P49662 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms