Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRCP23327 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HRCP23327 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HRCP23327 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HRCP23327 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HRCP23327 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HRCP23327 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRCP23327 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms