Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms