Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms