Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 RN7SL559P-201ENST00000476501 297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC074366.1-204ENST00000446277 552 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC046168.2-202ENST00000561123 926 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 BACH1-AS1-202ENST00000615718 700 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRHP20396 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRHP20396 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRHP20396 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRHP20396 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRHP20396 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRHP20396 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRHP20396 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRHP20396 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRHP20396 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC073465.1-201ENST00000456671 464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 AL357137.1-201ENST00000604645 203 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRHP20396 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms