Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBTFP17480 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms