Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZBED1O96006 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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