Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC6Q9UBN7 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms