Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ABCC13Q9NSE7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms