Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN18Q99952 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms