Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms