Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms