Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FHOD3Q2V2M9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms