Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT16Q17RD7 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms