Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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