Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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