Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms