Protein–RNA interactions for Protein: Q09FC8

ZNF415, Zinc finger protein 415, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF415Q09FC8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ZNF415Q09FC8 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ZNF415Q09FC8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms