Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms