Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms