Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COG7P83436 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
COG7P83436 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COG7P83436 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COG7P83436 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COG7P83436 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COG7P83436 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COG7P83436 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COG7P83436 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COG7P83436 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COG7P83436 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COG7P83436 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COG7P83436 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COG7P83436 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms