Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms