Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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