Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMPOP42166 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMPOP42166 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMPOP42166 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPOP42166 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPOP42166 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms