Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms