Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBP2P32456 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms