Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC27P30260 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC27P30260 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC27P30260 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC27P30260 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC27P30260 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC27P30260 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC27P30260 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC27P30260 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC27P30260 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms