Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NTF3P20783 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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NTF3P20783 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NTF3P20783 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NTF3P20783 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NTF3P20783 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NTF3P20783 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NTF3P20783 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NTF3P20783 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NTF3P20783 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NTF3P20783 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NTF3P20783 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NTF3P20783 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NTF3P20783 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NTF3P20783 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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