Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms