Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DMDP11532 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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