Protein–RNA interactions for Protein: O95361

TRIM16, Tripartite motif-containing protein 16, humanhuman

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16O95361 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRIM16O95361 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TRIM16O95361 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16O95361 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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