Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCF25Q9BQ70 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms