Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 IFFO1-205ENST00000436152 3101 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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SPOCK3Q9BQ16 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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SPOCK3Q9BQ16 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1G1-207ENST00000634654 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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SPOCK3Q9BQ16 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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SPOCK3Q9BQ16 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SCNM1-202ENST00000368905 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AL096817.1-201ENST00000623904 1775 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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