Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LYSTQ99698 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC9.59□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms