Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms