Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms