Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms