Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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