Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.2 ms