Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP135Q66GS9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms