Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 C5orf60-208ENST00000625191 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC009061.2-204ENST00000602476 524 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms