Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RFTN2Q52LD8 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms