Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHOD3Q2V2M9 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms