Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms